Sin embargo, aunque la siguiente temporada comenzó bien, una mala racha amenazó con dejarles fuera de los puestos de acceso a competición europea y a eliminarles en la Liga de Campeones sin sumar un solo punto, por lo que Baup fue destituido del cargo y fue reemplazado por José Anigo hasta final de temporada. Sin embargo, en la temporada 2015-16 el equipo sufrió una temporada para el olvido: Bielsa dimitió tras un solo partido, su sustituto Míchel González no fue capaz de reactivar al Marsella y al final el entrenador interino Franck Passi sólo pudo obtener la permanencia.
